Vereinsstruktur
Die NABU-Naturschutzstation Münsterland ist ein vom Ehrenamt getragener gemeinnütziger Verein mit einem hauptamtlichen Vorstand, einem ehrenamtlichen Beirat, hauptamtlichen Mitarbeitenden, FreiwilligendienstlerInnen und zahlreichen ehrenamtlichen Unterstützenden.
Trägerorganisationen
Die NABU-Naturschutzstation wird von vier Trägerorganisationen getragen. Die NABU Kreisverbände Coesfeld und Warendorf, der NABU Stadtverband Münster sowie der NABU Landesverband NRW entsenden jeweils Delegierte in den Verein.